本发明目的是针对采用现有技术光伏组件的封装方法和封装设备封装上盖板和下盖板材料不致的光伏组件时电池组件边缘处产生泡状物、易发生翘曲的不足，提供一种光伏组件封装系统及光伏组件封装方法，光伏组件封装方法，包括真空加热加压步骤、加压固化步骤和加压冷却步骤，在真空加热加压步骤中和加压固化步骤中，均采用柔性施压件加压，在加压固化步骤中，腔体闭合后，加热到粘胶材料的固化温度后向上腔充入压缩气体，使柔性施压件压靠在光伏组件上表面对光伏组件施压进行固化；在加压冷却步骤中采用上冷却板和下冷却板对光伏组件进行加压冷却，采用本发明的封装方法和封装系统，可有效减少或防止边缘处产生空腔和翘曲变形。