本实用新型公开了一种食品微生物发酵设备。本实用新型包括：第一箱，所述第一箱的底部设置有多个支撑腿，所述第一箱的一侧内壁上转动安装有第一轴的一端，所述第一轴的另一端延伸至第一箱的一侧并固定套设有第一皮带轮，所述第一轴的外侧设置有螺旋辊，所述第一箱的顶部设置有第二箱，通过电机、搅拌杆、拨动板、发热板、水泵、喷头等构件之间的相互配合，能够有效的提高发酵的效率，同时提高温湿度控制器能够有效的对第二箱内的温度和湿度进行调节，解决了现有的发酵装置通常都是静置发酵，同时不能够对发酵箱内的温湿度进行有效的调节，导致发酵效率较低，从而降低了生产效率的问题。