本发明涉及手性微纳结构制备领域，具体涉及一种悬臂形圆二色性微纳结构及其制备方法，包括衬底层和微纳结构层，微纳结构层包括周期排布的手性单元，手性单元包括介质层和贵金属膜，贵金属膜置于介质层上，介质层和贵金属膜中设有孔洞，手性单元还包括第一悬臂和第二悬臂，第一悬臂和第二悬臂粘附在孔洞的部分侧壁上，第一悬臂和第二悬臂的材料与贵金属膜的材料相同，第一悬臂和第二悬臂的高度不同。一方面，通过第一悬臂和第二悬臂的高度差调控贵金属膜上的电荷振动，导致了强圆二色性；另一方面，本发明仅通过一次电子束刻蚀，再结合电子束蒸发倾斜镀膜技术即可获得，相对于双层三维结构的其他制备方法，制作流程简单，具有好的应用前景。