本发明涉及半导体领域，特别涉及一种肖特基二极管及其制备方法。该方法包括：在衬底上外延n型氧化镓层；在所述n型氧化镓层制备金属掩膜层；在所述金属掩膜层上制备光刻胶并形成多个第二图形窗口，刻蚀形成凹槽结构；去除光刻胶，并对器件正面进行高温退火处理，形成多个带有凹槽结构的热氧化区；制备正面的阳极金属层和背面的阴极金属层；其中，所述阳极金属层的边缘位于最外侧的金属掩膜层上，且阳极金属层和金属掩膜层正所涵盖的区域下方包括至少一个带有凹槽结构的热氧化区。上述方法可以使阳极金属层和带有凹槽结构的热氧化区完全对齐，优化阳极结处电场，提高器件的耐高压特性并兼顾导通特性。