本发明涉及视频跟踪技术领域，具体涉及多目标对象轨迹生成方法、系统、电子设备和存储介质。该方法包括：获取包含多目标对象的视频数据；对获取的视频数据进行分帧处理，选取空白视频帧画面作为背景，确定分帧后视频帧画面中待跟踪目标对象，并生成待跟踪目标对象的位置框；根据待跟踪目标对象的跟踪特征点进行对应位置框的标号，并计算各位置框的中心点；获取连续视频帧中的多目标对象对应的中心点坐标，根据时序映射至对应的视频数据中，生成视频数据中多目标对象移动轨迹结果。本发明解决了难以对多目标跟踪并生成运动轨迹的问题，在视频中生成连续的中心点轨迹，避免出现多目标对象跟丢或轨迹错误情况。